浙江省小儿呼吸疾病诊疗研究中心设在本学科，学科拥有bet356儿科研究所、bet356心脏发育与转化研究所和bet356儿科药物研究所。儿科重点实验室已拓展至3200㎡，研究方向集中在：1、儿童心肺结构畸形的临床与机制研究；2、新生儿缺氧缺血性脑损伤基础和临床研究；3、儿童运动系统结构畸形的临床与机制研究；4、儿童泌尿生殖系统结构畸形的临床与机制研究；5、儿童变态反应疾病的机制和病因学研究；6、儿童疾病分子诊断标记物发现与基因治疗研究；7、儿童的发育与认知；8、儿童感染性疾病的诊治与机制研究等。2020年引进加拿大健康科学院宋伟宏院士，瞄准儿童重大疾病及罕见病整合优势学科，带动儿科临床与基础研究相结合，在国内形成科学研究的高地。 育英儿童医院近10年承担国家科技重大专项1项，国家自然科学基金31项（面上项目18项，青年基金13项），省部级课题68项，厅局级课题340余项，纵向科研经费超过2290万元；获得浙江省科学技术进步奖8项，其中二等奖2项。以第一作者或通讯作者发表SCI收录论文460余篇，论著影响因子最高17.047，中华系列和国内一级期刊论文810余篇。学科位列《中华儿科杂志》2005至2014年发文量最高机构第6位。bet356附属第一医院儿科近年承担3项国家级自然科学基金、4项省级自然科学基金、30余项市科技局课题等，发表SCI论文50余篇。